两个家蚕FKBP12基因的生物信息学及表达分析

论文发布时间：[2009-12-14] 范文大全编辑：Voive.net

所有作者：费晶晶张耀洲金勇丰李司

作者单位：浙江理工大学生物化学研究所

论文摘要：FKBPs是免疫抑制剂FK５０６的胞内受体蛋白，１２ kD的FKBPs是其代表性成员，在各物种细胞内广泛表达且高度保守，具有PPIase活性。目前只是发现在脊椎动物中有多个FKBP１２亚型，而我们通过NCBI家蚕基因库中检索到两条完整编码家蚕FKBP１２蛋白的mRNA序列，命名为Bm-FKBP１２A和Bm-FKBP１２B，基因登录号分别为DQ４４３１９７和 DQ４４３４２３。多物种序列比对发现，FKBP１２同源基因以及同源异性基因在氨基酸水平上具有高度的相似性。将两种FKBP１２基因的cDNA序列与家蚕全基因组序列进行比对，发现两个基因都由３个外显子和２个内含子组成。并对两个基因进行了启动子序列分析和染色体定位预测，发现两个基因都定位在２０号染色体上。克隆，表达，纯化了Bm-FKBP１２B蛋白，并制备了其多克隆抗体。通过相似EST搜索、荧光定量PCR和Western blotting分析了两个FKBP１２蛋白在家蚕各个发育时期以及各个组织的分布。发现Bm-FKBP１２A的转录本在各个组织均比Bm-FKBP１２B高；Bm-FKBP１２B的转录本在蛾期和胚胎期最高。Western blotting显示FKBP１２在丝腺和肠的表达量最高，暗示在吐丝前期FKBP１２蛋白可能对丝腺的基因表调控以及丝蛋白的形成具有重要作用。

关键词：家蚕 FKBP12 表达分析基因结构启动子分析

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