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封装式植物mRNA多聚腺苷化信号模式选择

论文发布时间:[2009-12-29]    范文大全    编辑:Voive.net

所有作者:吴小惠 吉国力 李庆顺

作者单位:中国厦门大学自动化系

论文摘要:本文基于模式植物拟南芥mRNA序列中多聚腺苷化[poly(A)]位点及其周围区域分布,对poly(A)信号区域的核苷模式进行特征提取。首先针对信号区域的保守性得到候选核苷模式;接着使用基于遗传算法的封装式特征选择筛选有效的特征子集;最后使用随机森林分类器进行特征子集验证。实验结果表明了本文的基于遗传算法的封装式特征选择能大大降低特征空间的维数,提高分类器性能,选出的特征子集能有效地用于植物的poly(A)位点识别。

关键词: 多聚腺苷化 模式发现 特征选择 遗传算法 Wrapper

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