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利用微流体芯片筛选组织特异性表达miRNAs

论文发布时间:[2010-01-18]    范文大全    编辑:Voive.net

所有作者:张启坤 徐根明 刘歆 隋承萍 高晓莲

作者单位:浙江理工大学生物工程研究所

论文摘要:非编码RNA日益成为国际上研究的热点,作为非编码RNA一部分的miRNA,被作为肿瘤标志物。另外,组织特异性表达是miRNA的一个重要特征,发现组织特异性表达的miRNAs是研究其生物学功能的第一步。本论文主要从以下三方面展开:(1)收集小鼠18种组织的miRNAs:通过对miRNA的300于篇文献进行挖掘得到小鼠各组织在不同发育时期和不同性别等各种条件下表达的miRNAs,为组织特异性表达miRNAs的筛选做准备;(2)采用微流体芯片技术筛选小鼠6种组织的miRNAs:取5次重复中至少有4次检测到信号的为可信结果,结果发现大脑、小脑、肝脏、肺、睾丸和肾中分别有246条,291条,209条,230条,84条,40条miRNAs表达。(3)结合(1)和(2)分析小鼠6种组织的组织特异性表达的miRNAs:通过对六种组织检测到的miRNAs进行比较筛选,得到除睾丸之外其它五种组织中特异性表达的miRNAs。为进一步得到更为可靠的结果,与基于大量文献收集的小鼠各组织在不同条件下表达的miRNAs进行再一次的比较筛选,结果发现,六种组织之间比较筛选出的组织特异性表达的miRNAs,有一部分miRNAs在其他组织中仍有表达。说明,微流体芯片技术与生物信息学的有机结合将为生物学的发展带来新的机遇。

关键词: 微流体芯片 microRNA 组织特异性表达 筛选

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